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Todo comenzó en 1.999, el departamento del Quindio había sido azotado por un fuerte terremoto,en ese año ,por la iniciativa de la junta directiva de la cámara de comercio de Armenia Quindio,decidieron crear una universidad que respondiera a requerimientos de formación del talento humano necesarios para fomentar los retos que venían en la región.
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Nacimos en el 2001 para revolucionar la educación en el Quindio. El otorgamiento de la personería jurídica a la C.U.E Alexander Von Humboldt, que comenzó su misión de formadora ofertando programas de Administración de Empresas Industriales y Comerciales , bajo el sistema de Formación Dual ,acogiendo un esquema de educación de amplia trayectoria y éxito en Alemania.
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En el 2005 comenzó a consolidarse la oferta en pregrado a través del inicio de actividades en los programas de Derecho y Psicología en extensión con la Universidad Autónoma de Bucaramanga.
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A finales de 2007, mediante convenio internacional suscrito con el colegio Mayor de Nuestra Señora del Rosario, se dio comienzo a las primeras cohortes de especializaciones de Derecho , que incluyen las Áreas Constitucional, contractual,Administrativo,Procesal y Laboral y de la seguridad social.
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En febrero de 2008 , se suscribió el convenio con la Universidad EAFIT , a través del cual se ofertaron las especializaciones en Administración de Empresas , Mercadeo y Finanzas, así como la primera maesria en Administración ofrecida directamente en la ciudad de Armenia.
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En el año 2008 se abre la sede principal de la universidad
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En el año 2010, se fortalecen las ofertas de formación tradicional y formación dual de la Von Humboldt . La institución seguía creciendo y de acuerdo con los estudios de mercado realizados por el alma mater, el Quindio tenia la necesidad de formar mas talento humano en el área de salud.
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En el año 2010 la Von Humboldt creó un nuevo programa bajo el sistema de Formación Dual Alemán , Ingeniería Industrial , que a la fecha es replicado por las otras universidades pertenecientes a la Red de Universidades de la Duale Hochschule Latinoamerica, de la cual CUE hace parte.
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En el 2011 se abre Sede alcázar (enfermería)
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Para el 2012 se da apertura a los programas propios de Derecho y Psicología bajo un concepto propio e innovador de su diseño curricular y en el modelo pedagógico a desarrollar.
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En 2014 y 2016 estos dos años se obtuvieron muy buenos resultados en las pruebas saber pro , de los estudiantes de Ingeniería Industrial y Administración de Empresas.
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Luego de un fuerte trabajo de la institución obtiene el registro calificado del programa de Medicina ,el cual fue diseñado bajo los mas estrictos criterios de calidad, y se consolida como una gran posibilidad para los quindianos de formarse como profesionales de la salud, al romper barreras como la admisión centrada en las pruebas saber 11 o Icfes.
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En el 2015 se abre la sede de medicina
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En el año 2016 la C.U.E Alexander Von Humboldt trajo a el Quindio la primera especialización en Salud Mental de la región, en convenio con la Universidad CES de Medellin.
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En el año 2019 se abre la sede campestre la floresta.