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La Universidad de Boyacá fue fundada en la ciudad de Tunja el 22 de septiembre de 1979, con el deseo de un académico oriundo de Guateque, el Dr. Osmar Correal Cabral y una economista bogotana, la Dra. Rosita Cuervo Payeras.
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De acuerdo con el "Acta de Fundación" protocolizada mediante Escritura Pública No.1777 del 17 de Octubre de 1979 en la Notaría Segunda de Tunja, "el Dr. Osmar Correal Cabral, promotor de la iniciativa, hizo una exposición detallada sobre la necesidad de crear una institución de educación, que por la excelencia de su trabajo académico llegara a constituirse en el primer centro privado de educación superior en Boyacá
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La primera sede se ubicó en el tradicional Pasaje de Vargas como “Corporación de Educación Superior de Boyacá”, la cual tiempo después, fue trasladada a la sede del Parque Santander, donde se consolidan dos programas tecnológicos
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En el primer documento elaborado como Plan de Desarrollo, presentado al ICFES para la obtención de la Personería Jurídica, y cuya síntesis fue publicada por su autor bajo el título desde "Nace una nueva institución Universitaria"
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En 1983 la Institución centró su sede en el Claustro Santo Domingo, momento en el que ofrecía más de diez programas académicos de pregrado y dos de postgrado
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En 1983 la Institución centró su sede en el Claustro Santo Domingo, momento en el que ofrecía más de diez programas académicos de pregrado y dos de postgrado.
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En el año 1993 se produjo el cambio de su naturaleza jurídica, obteniendo el carácter de “Fundación Universitaria de Boyacá”, año en el que sus Directivas inician la construcción de la primera edificación propia en el campus central de los Muiscas
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La Universidad de Boyacá, en el año 2011, extiende su cobertura académica en el departamento de Boyacá inaugurando la sede de Sogamoso con los programas de Derecho y Ciencias Políticas, Ingeniería Ambiental y Arquitectura, Psicología y la Especialización en Gerencia de Proyectos. También, dio inicio a la sede de Chiquinquirá con los programas de Derecho y Ciencias Políticas y Administración y Negocios Internacionales.
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Una vez que la institución cumplió todos los requisitos y exigencias del Ministerio de Educación Nacional referentes al cambio de carácter, el 16 de septiembre de 2004, se hace el reconocimiento como Universidad, mediante el Decreto 2910 del despacho del Ministro de Educación Nacional.
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A comienzos del 2013 se pone en funcionamiento el edificio administrativo con área de 2000 metros cuadrados.
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En la actualidad, el campus universitario de Tunja cuenta con 25.174 m² de área construida, consta de tres edificios para aulas, el edificio plazoleta, dos edificios de recursos múltiples donde se encuentran los laboratorios de ciencias e ingeniería y ciencias básicas; un edificio central académico-administrativo, un edificio de ciencias biológicas, un edificio de laboratorios y talleres de Diseño de Modas, Ingeniería Mecatrónica, Ingeniería Industrial y Psicologí
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En la actualidad, el campus universitario de Tunja cuenta con 25.174 m² de área construida, consta de tres edificios para aulas, el edificio plazoleta, dos edificios de recursos múltiples donde se encuentran los laboratorios de ciencias e ingeniería y ciencias básicas; un edificio central académico-administrativo, un edificio de ciencias biológicas, un edificio de laboratorios y talleres de Diseño de Modas, Ingeniería Mecatrónica, Ingeniería Industrial y Psicología.