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Se fue a Sevilla para ser asistente del arzobispo Alonso de Fonseca.
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Se doctoro en Teología en el Colegio de San Clemente de los Españoles de Bolonia.
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Se doctoró en teología y en artes.
promovido por su coetáneo el cardenal y legado pontificio Francesco Gonzaga -
Santaella estuvo al servicio de Ammannati como su capellán y asistente, residiendo con él en un palacio de Roma.2 Ahí trató con otros protegidos de Ammannati, como el humanista Francesco Filelfo, Giacomo Gherardi, Antonio Malvicino, Bartolomé Platina.
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En España fue tesorero de la iglesia de Ávila, rector de una parroquia de Cuenca y canónigo en Segovia.
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fue sacerdote de la catedral de Sevilla.
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Colaboró con el cabildo para la creación de una institución académica llamada estudio general en Sevilla, pero el proyecto no se llevó a cabo.
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Rodrigo compró un solar para construir el colegio y meses después comenzaron las obras.
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El papa autorizaba la erección del colegio y que se impartieran en él las enseñanzas de Artes, Lógica, Filosofía, Teología y Derecho Canónico y Civil.
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Rodrigo intentó crear un colegio en la ciudad similar al boloñés, "La bula fundacional del Colegio Santa María de Jesús".
Para ello contó con una carta de recomendación de la reina Isabel I, enviada por el embajador Lorenzo Suárez de Figueroa al papa Julio II.16 -
Rodrigo Fernández de Santaella
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Las obras del colegio terminaron y fue un Colegio para estudiantes pobres