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En un momento tan confesional de la historia colombiana, dado que se veia la necesidad de crear universidad, laica, libre, con libertad de catedra y de pensamiento, en 1890 (fecha exacta desconocida), Manuel Antonio Rueda Jara (Rector del colegio), se unió con Antonio José Iregui, Eugenio J. Gómez y Luis Antonio Robles, y fundaron la Universidad Republicana (posteriormente conocida como Universidad Libre), la cual comienza operaciones el primero de febrero de este mismo año.
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En el año 1919, dada una discrepancia de ideas entre directivas de la universidad, el general Benjamin Herrera alentó una huelga de estudiantes, los cuales se irian a la UEC, esto ocasionaria el cierre de la Universidad Republicana tal y como se conocia.
Luego, en 1921-22, se dio un cambio en la rezón social, de la mano del partido liberal, ademas de ser conocida así popularmente, la Republicana pasó a ser la Universidad Libre. -
La Convención Liberal celebrada en la ciudad de Ibagué, en el año 1922, en el acuerdo Número 6, de 3 de abril de 1922, aprobó recomendar a los liberales prestar decidido apoyo a la obra de la Universidad Libre. El 13 de Febrero de 1923, ahora como la Universidad Libre, comenzó a operar en las areas de Bellas Artes, Ciencias Sociales y Humanidades, Economía, Administración, Contaduría, Ingeniería, Arquitectura y Urbanismo.
