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La primera sede fue establecida en la Antigua Guatemala por la iniciativa del obispo Francisco Marroquín quien solicitó una institución de educación superior.
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La universidad fue fundada.
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El rey Carlos II de España promulga la real cédula de fundación de la universidad.
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La universidad abre sus puertas, albergando a 60 estudiantes.
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Se inaugura los estudios de medicina en la universidad de san Carlos.
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El doctor Miguel Fernandez inicia la catedra prima como el primer catedrático propietario de ella.
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Se graduó el primer bachiller en medicina en la universidad de San Carlos de Guatemala don Vicente Ferrer Gonzales,
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La universidad de San Carlos continuó despues del terremoto.
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Se trasladan al Valle de la Ermita
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Se ordenó la construcción del edificio, su constructor fue don Francisco Castillo de de la Riva.
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La universidad fue participante de la independencia mediante sus estudiantes a si como tambien de sus egresados.
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Tras derrocar a Mariano Galvez y con Mariano Rivera como jefe del estado de Guatemala se restituye el poder de la iglesia catolica sobre las catedras impartidas y se les devuelve el nombre de universidad.
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Se constituye como facultad de ciencias medica lo que ahora es el MUSAC.
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Durante el gobierno de Rafael Carrera se llamó Pontificia universidad de san Carlos de Borromeo a la máxima casa de estudios porque la iglesia reconoció como patronos de la universidad a San Carlos de Borromeo y a Santa Teresa de Jesús
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Se inauguró el colegio de San Vicente de Paul.
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El colegio San Vicente de Paul fue expropiado y consolidado por Justo Rufino barrios
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El instituto dental que ahora corresponde a la facultad de odontología según el decreto presidencial 203 pasa a ser dependencia de la escuela de medicina y farmacia.
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Las facultades de derecho y ciencias de la salud organizan un desfile conocido como huelga de dolores.
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Durante el gobierno de Manuel Estrada Cabrera la universidad bajo amenazas tuvo que cambiar su nombre a universidad Estrada Cabrera.
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En el conservatorio nacional de música permaneció la facultad de medicina.
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Es asesinado el licenciado Mario Lopez Larraye quien apoyo abiertamente el sindicalismo en el país, como homenaje a él, su rostro fue pintado en el mural de la biblioteca central de la universidad denominando a este lugar como plaza sindical Mario Lopez Larrave.
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Cae la dictadura y mediante una asamblea nacional la universidad de san Carlos logra la autonomía de sus facultades la cual le permitia a cada una elegir a sus autoridades.
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Se funda la asociacion de estudiantes universitarios AEU bajo el concepto de organizar al estudiantado y guiarlo hacua un futuri promisorio.
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nace el emblema de los huelgueros "la Chavela" pintada por el estudiante Hernan Martinez, se convirtió en el primer símbolo estudiantil femenino.
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Se escucha por primera vez el himno de guerra de los universitarios san carlistas.
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En años posteriores es creada la primera velada huelguera y luego la eleccion del primer rey feo.
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Bajo el gobierno de Lazaro Chacón es cuando el alma mater retoma el nombre de universidad de San Carlos de Guatemala
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Cuando el general Jorge Ubico llega a la presidencia la huelga y todas sus actividades quedan prohibidas.
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se dio una serie de manifestaciones en una de ellas las fuerzas del regimen ubiquista dio muerte a la maestra María Chinchilla.
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La asamblea legislativa por el decreto número 16 ratificó la autonomía universitaria elevándola a constitucional.
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El congreso de la republica promulga la primera ley orgánica de la universidad de san Carlos.
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Fue violada su autonomía por primera vez, por medio de invasiones militares.
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Se restituye la huelga por completo.
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Gguatemala vuelve a caer en manos de dirigentes militares con el general Eugenio Laugerud da inicio a un nuevo periodo de represión universitaria.
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La facultad de medicina se traslada a la ciudad universitaria ubbicada en la zona 12 de la ciudad de Guatemala.
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Es asesinado el secretario general de la AEU Oliverio Castañeda de León.
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Con el cambio de mandatarios las amenazas contra los san carlistas sucedieron dentro de la propia universidad, es asesinado el licenciado Leonel carrillo Rivas quien un año antes fue rector de este plantel.
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Fue violada su autonomía por segunda vez, por medio de invasiones militares.
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La facultad de medicina se encuentra ubicada en el centro universitario metropolitano (CUM).