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Juan Bautista Aguirre Y carbo nace el 11 de abril de 1725 en Daule Guayas. Hijo del capitán de milicias Carlos Aguirre Ponce de Solís y Teresa Carbo Cerezo como criollo en la época colonial.
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Juan Bautista inicia sus estudios en el colegio Seminario San Luis de Quito.
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Juan Bautista estudia en esta institución y al ser un seminario este debe residir en la misma en tanto duren sus estudios
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Tras su residencia de 30 años en el colegio Seminario de San Luis de Quito ingresa a la compañía de Jesús para ejercer sus estudios y enseñar.
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Mientras está en la compañía de Jesús este empieza a enseñar en la Universidad de San Gregorio Magno
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Se expulsa a los jesuitas de Hispanoamérica por incumplir la ley del no usar armas de fuego en contra de indígenas y Juan Bautista parte con rumbo a Faenza, Italia.
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Llega a Faenza, Italia y se establece en el convento de Ravena como padre superior a la vez que en el colegio de Ferrara se vuelve rector.
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Juan Bautista Aguirre y Carbo muere a sus 61 años en Tívoli, Italia. A partir de este día es recordado como padre, jesuita y profesor por los cargos en los que desempeñó a través de su vida.
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Tras años de ser recordado como padre y profesor el intelectual Gonzalo Zaldumbide publica bajo el nombre "Un Gran poeta guayaquileño del S. XVII, el Padre Juan Bautista Aguirre" las primeras obras de poesía encontradas de Juan Bautista.
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A pesar de que las primeras obras fueron encontradas y publicadas entre 1900-1918 la mayor parte de sus poemas fueron encontrados años más tarde.