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La UN sería fundamental para esos propósitos
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gracias a Francisco de Paula Santander se creó la Universidad Central de la República la cual daría origen a la UN
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El 22 de Septiembre se creó la Universidad Nacional de los Estados Unidos de Colombia mediante la ley 66 de 1867 en el gobierno de Santos Acosta. La Unal comenzó a funcionar en el siguiente año dirigiéndola como el primer rector Manuel Ancízar
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Durante este periodo la UN contó con 6 facultades, adquiriendo el Observatorio Astronómico Nacional, el Laboratorio Químico Nacional, la Biblioteca Nacional, y el Hospital de la caridad y el militar
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Tras la caída de los liberales y la subida de los conservadores y la Regeneración, generó el fin de la libertad de cátedra de la UN
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En este lapso de tiempo surgieron 20 nuevas carreras como arquitectura, mediciona, ondotología, entre otras.
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En 1936 se incorporó la Escuela Nacional de Minas en Antioquia y dos años más tarde la Escuela de Agricultura Tropical de Medellín. Con esto comenzó oficialmente a operar la sede Medellín de la Universidad
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Gracias a la gestión del gobernador José J. Montoya y al rector Gerardo Molina, se fundó esta sede
