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Nace como la primer institución educativa de la Nueva Granada en 1573 Mediante la bula Romanus Pontifex, emitida por el papa Gregorio XIII con la cual confirma su fundación en 1580.
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Fue fundada por la Orden de Predicadores (Padres Dominicos) el 13 de junio de 1580.
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Se fundó el Colegio Santo Tomás y posteriormente se fusionó con la Universidad de Estudios Generales. Nació así el Colegio-Universidad Santo Tomás que posteriormente se llamaría Universidad Tomística.
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Cerrada por el genenral Tomás Cipriano de Mosquera
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La Universidad Santo Tomás Colombia es una institución de Educación Superior católica de caracter privadoesta presente en cinco ciudades del país con sedes y seccionales en Bogotá, Bucaramanga, Medellín, Tunja y Villavicencio en la modalidad presencial y 23 Centros de Atención Universitaria CAU en la modalidad Abierta y a Distancia.
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Se restauró en Santafé de Bogotá por la Provincia de San Luis BERTRÁN de Colombia, de la Orden de Predicadores, con el nombre de Universidad Santo Tomás de Colombia, con personería jurídica mediante la Resolución n.º 3645 del 6 de agosto de 1965, ofreciendo las carreras de Ingeniería Civil, Economía y Admon. de Empresas, Filosofía y Derecho.
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Inicio de las actividades académicas de la Usta Bucaramanga en el colegio Cristo rey con los programas de derecho, economía, ciencia política, administración de empresas y contaduría pública.
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Universidad Santo Tomás fue una de las pioneras en ofrecer programas con la modalidad de educación a distancia, con la cual se han formado un alto número de profesionales de diferentes regiones del país
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Se ha consolidado como una de las mejores universidades de la región y ofrece diez programas profesionales, once especializaciones, ocho maestrías y un doctorado.
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La Universidad hoy en día ofrece tecnologías, programas profesionales, licenciaturas y posgrados en la modalidad presencial y a distancia, en 31 ciudades del país.
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Actualmente se ofrecen a nivel de Pregrado en la modalidad presencial, los programas de Administración de Empresas Agropecuarias, Contaduría Pública, Derecho, Ingeniería Ambiental, Ingeniería Civil, Negocios Internacionales y Psicología.
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PRIMER UNIVERSIDAD DEL PAÍS CERTIFICADA EN ALTA CALIDAD EN TODAS SUS SEDES. La acreditación multicampus que recibió la universidad quedó consignada en la resolución 01456 del 29 de enero del 2016. Con este reconocimiento, la universidad se acredita como la primera institución privada en recibir este reconocimiento.
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La Universidad Santo Tomás ofrece 81 programas de pregrado, 104 de posgrado y cuenta con 32.535 estudiantes. Del programa del Ministerio de Educación Nacional ‘Ser pilo paga’, la institución ha acogido a 254 jóvenes.