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Solicitó la fundación de una institución de educación superior, la cual tubo su primer sede en la Ciudad de Antigua Guatemala.
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El Rey Carlos II de España promulga una cédula de fundación de la Universidad y cinco años después abrió sus puertas.
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En el año 1777 la Universidad se traslada al Valle de la Ermita, conocido hoy en día como la Ciudad Capital.
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La Universidad participo e impulso la independencia, mediante sus estudiantes y egresados. El Principal representante fue Jose Cecilio del Valle, se le atribuye la redacción del acta.
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Fue durante el gobierno de Mariano Gálvez en donde la Universidad fue eliminada, se estableció como una academia de estudios, con el proposito de responder a una educación laica.
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Con el conservador Mariano Rivera Paz como jefe, se restituye el poder de la iglesia católica sobre las cátedras que se impartían y se le devuelve el nombre Universidad.
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Dichas facultades se unen para organizar un desfile bufo que se conoce como huelga de dolores.
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Bajo el gobierno de Manuel Estrada Cabrera debido a las amenazas, la Universidad tubo que cambiar su nombre. Sin embargo 22 años después cae la dictadura y la Universidad de San Carlos logra la autonomia de sus facultades.
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Bajo el gobierno de este año el Alma Mater retomo su nombre original.
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Se dieron manifestaciones por la inconformidad que se sentia hacia el gobierno de Jorge Ubico. En una de las manifestaciones fuerzas del gobierno dieron fin a la vida de la maestra Maria Chinchilla Recinos, esto desencadeno el rompimiento de dicha dictadura.
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Tuvo la iniciativa de comprar los terrenos en donde actualmente se encuentra el campus central.
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Tras muchas amenazas que la universidad recibió en este año el rector fue asesinado.
