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El 31 de enero de 1676 quedó plasmado en una real cédula el nacimiento de la primera universidad de Centroamérica
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El proceso para la fundación de la Universidad fue extremadamente complicado, el 7 de enero de 1681, que iniciaron las lecciones de 5 nuevas cátedras en la Universidad de San Carlos. En este año inicial, hubo 60 alumnos matriculados para iniciar sus estudios en dicha Universidad.
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El Doctor José Baños y Sotomayor toma posesión como primer rector de la Universidad.
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En el año de 1687, el Papa Inocencio Undécimo otorgó el título de Pontificia a la universidad, lo que hacia que los egresados de dicha casa de estudio tuvieran el mismo nivel que los estudiantes de los centro educativos de Europa.
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El Doctor Miguel Fernández inicia la cátedra prima como primer catedrático propietario de ella.
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Se gradúa el primer Bachiller en Medicina, Don Vicente Ferrer González.
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Durante los años de 1750 hasta 1790 aproximadamente se viven muchos cambios en la Universidad San Carlos de Guatemala. Todo inicia con el terremoto de 1751, en el cual, debido a la destrucción, se tuvo que renovar varios de los edificios y casas de la Antigua Guatemala, creando la idea de una renovada ciudad.
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en el año 1782, se adicionan, a petición del señor José Antonio Liendo y Goicoechea y con anuencia del rector, Isidro Sicilia, como parte de una reforma a la educación superior, situación que se venía dando en las universidades europeas por más de 30 años, las cátedras de anatomía, patología y terapéutica, situación importante en la mejora educativa, toda vez que en otros lugares de América no se enseñaba ni matemática.
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Fue participante en la independencia en 1821 con principal representante José Cecilio del Valle quien redactó el acta de independencia.
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Durante el gobierno de Rafael Carrera, se le asigna a la universidad el nombre de "Real y Pontificia Universidad de San Carlos de Guatemala".
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en su lugar creó la Universidad Nacional de Guatemala, con las Facultades de Jurisprudencia y Ciencias Políticas y Sociales, y Medicina y Farmacia. Finalmente
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1883, Mariano Rivera Paz como jefe del estado, regresa el poder de la iglesia católica sobre las cátedras y le atribuyen el nombre de universidad de nuevo.
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El Instituto Dental pasa a ser dependencia de Medicina y Farmacia.
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1898, se unen las facultades de Derecho y Ciencias de la Salud para organizar un desfile bufo, surge el periódico "no nos tientes", como medio de protesta en son de burla.
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En 1921, se restablece la Huelga de Dolores, uno de los eventos más importantes de la USAC hasta la fecha.
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La Universidad de San Carlos de Guatemala, sufrió cambios marcados luego de la Revolución de 1944. El primer y más importante cambio que sufrió la USAC fue que, por medio del decreto 12, se establece la autonomía de la Universidad, para que evitar que cualquier gobernante pudiera controlar la universidad
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En el año de 1945 se creó la primera Ley Orgánica de la Universidad, la misma que fue modificada en el año de 1947.
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El Dr. Carlos Martínez Durán, primer rector electo, compra los terrenos donde se construyeron las actuales instalaciones de la USAC
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El edificio de la escuela de Medicina, Farmacia y Dental, es destinado como sede del Centro Cultural Universitario.
La Facultad de Ciencias Medicas se traslada a "La ciudad Universitaria" -
La Facultad de Ciencias Medicas se traslada al Centro Universitario Metropolitano (CUM)
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El Consejo Superior Universitario juramentó como decano de la Facultad de Ciencias Médicas al Dr. Jorge Fernando Orellana Oliva en un acto solemne realizado en el Salón Mayor del Museo Universitario, al que asistieron autoridades, catedráticos, estudiantes y otros honorables invitados.
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Después de permanecer cerrado por unos 20 días el Centro Universitario Metropolitano (CUM) abrirá sus puertas para continuar con sus actividades
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13 de marzo de 2020. En junio los casos ya superan los mil casos diarios. Y en Julio, con un nuevo tablero de datos, los números han empezado a ser todavía menos confiables.
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Ante la pandemia del covid-19, la Universidad de San Carlos ha tenido que adaptarse a una “nueva normalidad”, las clases presenciales fueron cambiadas por los cursos en línea, y en esa misma modalidad se hacen las evaluaciones de primer ingreso.
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el lunes 25 de enero inician las clases virtuales en la facultad de medicina, luego de cambiar la fecha de inicio y complicaciones con las asignaciones e inscripciones de los estudiantes