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Mediante mediante la bula Romanus Pontifex, el papa Gregorio XIII erigió en el Convento de Nuestra Señora del Rosario (conocido también como Convento de Santo Domingo) de Santa Fe una Universidad de Estudios Generales.
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Gaspar Núñez de Figueroa, en su testamento, promovió la fundación del Colegio Santo Tomás de Aquino- Bogotá.
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Se fusiono a perpetuidad entre el Colegio y la Universidad
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Uno de sus fundadores, Álvaro Cueto, profesor de Introducción a la economía, otorgó los primeros grados, donde se volvió exclusivo en ese año.
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La Universidad Santo Tomás tuvo que afrontar un duro pleito con las autoridades gubernamentales que intentaban crear una universidad pública a costa de la supresión de la Tomística,
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Bajo el gobierno del dictador Tomás Cipriano de Mosquera, la Universidad Santo Tomás, vio cerradas sus puertas por segunda vez, al quedar está incluida dentro de la ley de supresión de comunidades religiosas y expropiación de bienes eclesiásticos.
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Se restaura la Universidad Santo Tomás por el sacerdote dominico Luis Torres Gomez O.P en la ciudad de Bogotá con los programas de Ingeniería Civil, Derecho,Ciencias Políticas,Economía y Administracion de Empresas
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Se creo la seccional de Bucaramanga y se inicia sus actividades academicas.
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Se comienzan labores en la facultad de Ingeniería Electrónica.
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Se inagura el seccional de Tunja
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Se constituyó la sede de Medellín con los programas de arquitectura e ingeniería en telecomunicaciones.
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se inagura la seccional de Villavicencio con las facultades de Administración de Empresas Agropecuarias, Comercio Exterior y Derecho, con 160 estudiantes provenientes de todas las regiones del Meta y departamentos aledaños.
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La Universidad Santo tomás inagura su nuevo Coliseo Sol de aquino en el campo deportivo y cultural en piedecuesta
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Se celebra los 40 años de hsitoria en el seccional de santander por este importante motivo la universidad fue condecorada por el Senado de la República, La cámara de representantes, La Asamblea de Santander, El Concejo de Bucaramanga y la Alcadía de Bucaramanga
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Se convierte en la primera Universidad Privada con presencia nacional en obtener la Acreditación Institucional de Alta Calidad bajo la modalidad Multicampus.
