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El obispo Francisco Marroquín solicita la fundación de una institución de educación superior. El obispo junto con el capitán Pedro Crespo de Suárez hicieron todas las gestiones necesarias ante el rey de España para hacer una universidad en la ciudad de Santiago de Guatemala.
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El rey Carlos II de España promulga la real cédula de fundación de la Universidad de San Carlos de Guatemala.
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La Universidad de San Carlos de Guatemala abre sus puertas dándole lugar a 60 estudiantes. Inició sus actividades impartiendo 7 cátedras, las cuales eran: Teología escolástica, Teología moral, cánones, Leyes, Medicina, y dos de lenguas. Otorgando los grados de bachiller, licenciado, maestro y doctor.
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La ciudad de Santiago de los Caballeros (actualmente Antigua Guatemala) fue sacudida por un fuerte terremoto que destruyó casi por completo a la Universidad de San Carlos de Guatemala.
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Debido a los daños provocados por el fuerte terremoto, la Universidad de San Carlos de Guatemala se vio forzada a trasladarse a la Nueva Guatemala De la Asunción. Específicamente, al Valle de la Ermita.
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La Universidad de San Carlos de Guatemala fue participante e impulsora mediante sus estudiantes y egresados de la independencia. Siendo el principal representante, José Cecilio del Valle.
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Durante el gobierno liberal del Dr. Mariano Gálvez, la Universidad de San Carlos de Guatemala fue eliminada, estableciéndola como una academia de estudios con el propósito de darle lugar a la educación laica.
Se redacta la primera declaración de Derechos Humanos en Guatemala. -
Con el conservador y jefe del Estado de Guatemala Mariano Rivera paz, se restituye el poder de la iglesia católica sobre las cátedras impartidas y se le devuelve el nombre ´´Universidad´´.
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Se unen las facultades de Derecho y Ciencias de la salud para organizar un desfile bufo conocido como "Huelga de Dolores". Se realizó la semana previa a Semana Santa. y junto con la huelga, nació un periódico en la facultad de Medicina llamado "No nos tientes". Las 2 protestas se crearon para manifestar en forma de burla su inconformidad con el gobierno en turno.
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Bajo amenazas del gobierno de Manuel Estrada Cabrera, la universidad se vio forzada a cambiarse el nombre a "Universidad Estrada Cabrera"
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Se logra la autonomía de todas las facultades de la Universidad de San Carlos de Guatemala. Lo cual les permitía elegir a sus autoridades.
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Se funda la Asociación de Estudiantes Universitarios (AEU) con el propósito de organizar a los estudiantes y guiarlos a un futuro prometedor.
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Fue creada por el estudiante Hernán Martínez y representada por un esqueleto que está bailando con la mano izquierda en alto y la derecha sobre el pubis. La Chabela se convirtió en el primer símbolo estudiantil femenino.
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Se escucha por primera vez La Chalana, la cual es el himno de guerra de nosotros los sancarlistas. Fue compuesta por los estudiantes Alfredo Valle Calvo, José Luis Valcárcel, David Vela y Miguel Ángel Asturias.
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El alma máter recupera el nombre de "Universidad de San Carlos de Guatemala"
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Con la llegada a la presidencia de Jorge Ubico, la huelga y todas sus actividades quedan prohibidas, causando así, la represión de los sancarlistas.
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Se dan algunas series de manifestaciones. En la cual, en una, las fuerzas de ubico dieron muerte a la maestra María Chinchilla, lo cual provocó el derrocamiento de la dictadura de Jorge Ubico.
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El decreto No.16 ratificó la autonomía de la Universidad de San Carlos de Guatemala y así la elevó constitucionalmente.
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El congreso de la República de Guatemala promulga la primera ley orgánica de la Universidad de San Carlos de Guatemala.
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La Huelga de Dolores es restituida por completo y desde ahí que no ha sido suspendida nuevamente.
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Inicia otro periodo de represión ante los sancarlistas.
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El licenciado Mario López Larrave es asesinado días después de haber apoyado abiertamente el sindicalismo en el país. A su honor, la creación de la Plaza Sindical Mario López Larrave.
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El secretario general de la AEU es asesinado.
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El licenciado Leonel Carrillo Ríos es asesinado dentro de la misma universidad.
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Actualmente, la Universidad de San Carlos de Guatemala cuenta con 10 facultades, 9 escuelas, 13 centros regionales y 3 medios alternativos de información para la población.