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Tras ya casi cien años ante la corona real española y con la decisiva intervención de Fray Antonio Alcalde y Barriga, en aquel entonces obispo de Guadalajara, se inaugura la Real institución de Guadalajara que por orden cronológico se convierte en la Segunda de la Nueva España, y la institución adopto el modulo de la Universidad de Salamanca e inicia en las cátedras de Medicina, Derecho, Teología y Filosofía -
La universidad se encuentra relacionada con la historia de la nación mexicana, entre 1826 y 1860, y como consecuencia de los enfrentamientos entre los gobiernos liberales y conservadores que se provocaron después de las guerras de Independencia, la Universidad sufre cierres y rupturas que originaron cambios entre institutos y Universidades -
Con el triunfo de la Revolucion se busca establecer un proyecto educativo nacionalista en el pais -
En 1914, el gobernador de Jalisco Manuel M. Diéguez funda la Escuela Preparatoria de Jalisco como una institución precursora -
Una década después, en 1925, el gobernador José Guadalupe Zuno instaura nuevamente la Universidad de Guadalajara, luego de 65 años de prolongada ausencia. -
Hacia las ultimas décadas del siglo XX, la Universidad inicia un proceso de reforma que con nuevas estructuras académicas y administrativa, la Universidad expande sus servicios de nivel medio superior a todo el territorio del Estado de jalisco y fortalece su vocación científica y de difusión de la cultura