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Fue el primero en utilizar un microscopio óptico formado por varias lentes. Al observar una laminilla de corcho, descubrió diminutas "celdillas" a las que denominó "cella" ("celdillas" o "células" en latín).
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De las primeras observaciones a las teorías celulares
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Con un microscopio muy sencillo fabricado por él, descubrió pequeños seres vivos en el agua de las charcas, a los que llamó "animalículos".
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Descubrió el núcleo mientras estudiaba células vegetales.
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Describió el medio intracelular, al que denominó protoplasma, y que hoy conocemos como citoplasma.
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Schleiden concluyó que todos los tejidos vegetales estaban formados por células. Al año siguiente, Schwan extendió esta conclusión a los animales y propuso que la célula es la unidad elemental de los seres vivos.
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Formuló el axioma: "Toda célula procede de otra célula ya existente".
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Propuso que las características de las células se transmiten desde las células madre a las hijas.
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Empleó un método de tinción con sales de plata para estudiar el tejido nervioso y demostró que la neurona es la unidad anatómica y funcional del sistema nervioso.
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Descubrieron, de manera independiente, que en los cromosomas de las células se localiza la información genética.
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Descubrieron la estructura del material genético presente en el núcleo de las células.
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Desarrolló una teoría que explica el origen de las células eucariotas a partir de las procariotas.