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En mayo de 1964, en la región de Marquetalia, Tolima, un grupo de campesinos liderados por Manuel Marulanda Vélez y Jacobo Arenas fundó las Fuerzas Armadas Revolucionarias de Colombia (FARC) como una organización guerrillera de inspiración marxista-leninista, en respuesta a la represión estatal y la desigualdad social.
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El 19 de abril de 1970, tras las elecciones presidenciales, un grupo de estudiantes y militantes socialistas formó el Movimiento 19 de Abril (M-19), denunciando fraude electoral y buscando un cambio democrático mediante la lucha armada.
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El 6 de noviembre de 1985, el M-19 tomó el Palacio de Justicia en Bogotá para exigir un juicio político al presidente Belisario Betancur. El asalto y la posterior operación militar dejaron cerca de 100 muertos, incluyendo magistrados y guerrilleros.
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En marzo de 1990, el M-19 firmó un acuerdo de paz con el gobierno de Virgilio Barco, culminando en su desmovilización y transformación en un partido político, la Alianza Democrática M-19.
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En 1997, diferentes grupos paramilitares se unieron para formar las AUC, una organización armada ilegal con el objetivo de combatir a las guerrillas y expandir su influencia territorial, financiada principalmente por narcotráfico y extorsión.
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En 2000, Colombia y Estados Unidos lanzaron el Plan Colombia, una estrategia conjunta para combatir el narcotráfico y fortalecer las fuerzas militares del país, con un enfoque en reducir la producción de drogas y debilitar a los grupos armados.
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En 2003, el gobierno de Álvaro Uribe firmó un acuerdo de paz con las AUC, logrando la desmovilización de aproximadamente 30,000 combatientes para 2006, aunque muchas estructuras se reorganizaron en bandas criminales.
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El 24 de noviembre de 2016, tras cuatro años de negociaciones en La Habana, el gobierno de Juan Manuel Santos firmó un acuerdo de paz con las FARC, poniendo fin a más de 50 años de conflicto armado con este grupo. El acuerdo fue ratificado por el Congreso después de ser rechazado en un plebiscito.