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Acumulación de observaciones (desde 1675 aproximadamente hasta la mitad del siglo XIX), que arranca con el descubrimiento de los microorganismos por Leeuwenhoek (1675). -
Finales del siglo XIX, donde las figuras de Pasteur y Koch encabezan el logro de cristalizar a la microbiología como ciencia experimental bien asentada.
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Los mohos y las bacterias se generan de forma espontánea y que no llegan a proliferar en un medio estéril, es así que dentro de los logros más destacados se encuentra el desarrollo de la técnica de calentamiento controlado que actualmente se conoce como la pasteurización
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Sostuvo que las infecciones postoperatorias eran causadas por microorganismos, los cuales al ingresar por la herida causaban la putrefacción y la sepsis de la misma, por lo que ésta teoría lo llevó a tomar medidas de seguridad, como rociar fenol en sus pacientes antes de una intervención quirúrgica.
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Miembro del primer congreso de microbiología en Paris donde presentó un aparato para determinar el índice Delta que lleva su nombre, trabajó en la fiebre amarilla y la peste bubónica, preparó un antígeno para diagnosticar la lepra, fue profesor de la Facultad de Medicina en La Paz, en las disciplinas de enfermedades tropicales y parasitología.