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El 17 de mayo del 2006 con el acuerdo numero 072 del honorable consejo directivo de la universidad de boyaca, se da origen al programa de ingenieria mecatronica.
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El 6 de abril del año 2006, a través de la resolución 1875, el ministerio de educación nacional otorga al programa de ingeniería mecatronica el registro calificado por siete años. Este registro le permitió a la universidad de Boyacá poder abrir el programa académico para el ingreso de estudiantes.
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El 6 de julio del 2009 ingresa el primer grupo de estudiantes para el programa de ingeniería mecatronica en la universidad de Boyacá, Fueron recibidos por el decano de la facultad de ciencias e ingeniería quien en ese momento seria el director de programa.
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El primero de noviembre del 2010 se realizó la Inauguración del edificio 10, donde actualmente se encuentran las oficinas y laboratorios del programa de ingeniería mecatronica.
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El 12 de febrero del 2011 se realiza la creacion de los laboratorios de electrónica, automatización y centros de manofactura para el uso de los estudiantes de ingeniería mecatronica.
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El 11 de septiembre se crea el primer semillero de investigación de la universidad de boyacá para los estudiantes de ingeniería mecatronica
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El 23 de agosto de 2012 los estudiantes de ingeniería mecatronica de la universidad de Boyacá participaron en calidad de ponentes en el congreso de ingeniería que se llevó acabo en Medellín.
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El primero de noviembre se llevó a cabo el primer concurso de robótica en la universidad de Boyacá
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El 13 de mayo del 2013 se realizó la participación del semillero de investigación SIROM en encuentro regional con clasificaron al encuentro nacional.
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El 17 y 18 de mayo del 2013 los estudiantes de ingeniería mecatronica participaron en el concurso de robótica móvil organizado por la uniagraria en la ciudad de Bogotá obteniendo el Segundo puesto en dicha competencia.
