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La primera fase de la Campaña Nacional comprende del primero de marzo de 1856, día del la proclama del presidente Mora.
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Una columna del ejercito filibustero desembarco en el puerto La virgen, el 13 del mismo mes, con rumbo a San Juna Sur.
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El 20 marzo de 1856 se enfrentaron, por primera vez, el ejército nacional y los filibusteros, en la hacienda ganadera Santa Rosa
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El 10 de abril una tropa mercenaria intento desembarcar en el río Sardinal y ocurrió el segundo enfrenamiento.
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En la madrugada del 11 de abril de 1856, ambos ejecitos se enfrentaron en una batalla que se prolongo por mas de 20 horas
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Mora Porras decidió bloquear el puerto de San Juan Sur y prohibir la navegación en San Juan Norte. Esto para cortar el apoyo que Walker recibía.
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El 22 de diciembre los Nacionales atacaron por sorpresa a los filibusteros localizados en el puerto de La Trinidad
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En febrero de 1857 había llegado a San Juan del Sur el navío Saint Mary capitaneado por Charles H. Davis. Este estadounidense solicito permiso para hablar con Walker, a fin de que entregara la ciudad de Rivas y se rindiera.
