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El equipo de donde nació atlético nacional fue un equipo de barrio mas exactamente en el barrio buenos aires ubicado en el centro oriente de medellin y comenzó con el nombre de unión FC
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Fundado bajo el nombre de Club Atlético Municipal de Medellín, aunque fue constituida el 30 de abril de 1947 en la notaría primera de Medellín.
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en 1950 se le dio el nombre de Club Atlético Nacional y desde entonces ha conservado este nombre
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El club se coronó campeón por primera vez en su historia en 1954 bajo la dirección técnica de Fernando Paternoster
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La final de 1989 se jugo frente a Olimpia quien se difinio desde el punto de penales quedando 5-4 a favor de Atlético Nacional ese día gano su primera copa Libertadores
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Desde el año 2000 mas exactamente en marzo se le da el escudo que aun conserva
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Atlético Nacional logró su segunda Copa Libertadores el 27 del 2016, cuando derrotó en la final a Independiente del Valle, sorpresa de la competición por haber eliminado a River Plate y Boca Juniors de Argentina. Además también sacó de la copa a Pumas de México, el segundo mejor equipo de la fase de grupos.
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Atlético nacional gano la ultima edición de la copa Colombia frente al once caldas imponiendo un 2:1 en el marcador final
