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En 1821, con el logro de la Independencia, se mantiene la estructura básica con cuatro ministerios.
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Para 1835 con la creación del quinto ministerio el Ministerio de Relaciones Interiores, inicia el proceso de diversificación del sistema administrativo en materia de estructura y funciones.
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El gobierno, obtiene competencias, en materia educativa, servicios de correos y telégrafos, y la construcción de obras públicas, entre otros.
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Con Porfirio Díaz se implementó en el presupuesto la partida doble, reglamentos interiores de las diferentes secretarías y la consolidación de la deuda pública.
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Con la promulgación de la Constitución de 1917 será necesario la reforma administrativa para alcanzar los ideales revolucionarios; con ello, se promueve la Ley de Secretarías que configura los órganos centrales en secretarías y departamentos administrativos.
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1921-La SEP, creada en 1921, recibe la mayor partida económica. En el periodo del Maximato se establece el impuesto sobre la renta. 1928-La Secretaría de Hacienda es asignada como unidad autónoma para la elaboración del Presupuesto de la Federación, incluyendo “estudios sobre la organización administrativa, coordinar actividades y sistemas de trabajo para lograr eficiencia en los servicios públicos.
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En 1928 la Secretaria de Hacienda es asignada como unidad autónoma para la elaboración del presupuesto de la federación incluyendo estudios sobre la organización administrativa.
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Miguel Alemán. 1946, se publica la Ley de Secretarías y Departamentos de Estado. Adolfo López Mateos, 1958, se reforma la Ley de Secretarías y Departamentos de Estado; introduce la Secretaría de la Presidencia para formular objetivos y procedimientos de planeación económica y social del país. 1965. Se crea la Comisión de Administración Pública, buscando: técnicas de organización administrativa, preparación del personal gubernamental y la eficiencia en el desarrollo económico y social.
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En este periodo, la estructural de la administración centralizada fue reorganizada hasta tres veces, y con las Leyes de Secretarías de Estado y Departamentos Administrativos
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Adolfo López Mateos, en Materia de la Administración Pública, se formó la Ley de Secretarías y Departamentos de Estado, en la cual se introduce la Secretaría de la Presidencia para formular los objetivos y procedimientos de la planeación económica y social del país.
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El Estado como medio para formación de capital y desarrollo económico del país da origen al gabinete económico, promueve la regulación económica nacional y realiza financiamiento selectivo a los sectores prioritarios. Ley de Secretarías (programación y coordinación del sector público). Ley para el control de Organismos Descentralizados y Empresas de Participación Estatal (supervisión financiera, control a los fideicomisos del Estado y control administrativo del Ejecutivo Federal).
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En 1971 es creada la Secretaría de la Presidencia y la Dirección General de Estudios Administrativos (DGEA), que sustituyó a la CAP, y queda a cargo de las actividades en materia de reforma administrativa.
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La CAP se concentra en dictaminar la más adecuada estructura de la Administración Pública y sus posibles modificaciones; también, propone reformas a la legislación y las medidas de administración que procedan.
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El gobierno de Echeverría partió de la creación de organismos descentralizados, empresas de participación estatal, numerosos fondos, comisiones y fideicomisos (por ejemplo, el Instituto de Fondo Nacional de la Vivienda para los Trabajadores, INFONAVIT).
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a DGEA estuvo a cargo de la coordinación global de los trabajos de reforma administrativa y publicó las Bases para el Programa de Reforma Administrativa del Poder Ejecutivo Federal 1971-1976, integrado por once programas, proporcionando la referencia para las reformas en materia de programación, gasto público, entre otros. Para la institucionalización de la administración pública se crea la Secretaría de Programación y Presupuesto.
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Con Salinas de Gortari-Desconcentración y descentralización; Desreglamentación administrativa; Agilización de trámites; y Modernización integral de los sistemas de atención al público. 1996, se decretó el Programa de Administración Pública-Transformar la Administración Pública en una organización eficaz, eficiente y con cultura de servicio; Combatir la corrupción y la impunidad. Con la declaración del milenio, en el año 2000, se refuerza la esencia de la Administración Pública.
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El papel de la sociedad civil en relación a la participación de la planeación nacional recobra importancia.
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Para 1996, se decretó el Programa de Administración Pública (1995-2000) que contiene dos grandes objetivos: a) transformar la Administración Pública en una organización eficaz, eficiente y con cultura de servicio; b) combatir la corrupción y la impunidad.
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Las influencias de organismos internacionales apoyaron esta modernización administrativa y con la Declaración del Milenio, en el año 2000, se refuerza la esencia de la Administración Pública: mejorar la capacidad de los servidores públicos; desarrollar una eficaz y eficiente administración financiera; promover la innovación permanente, e impulsar las tecnologías de la información y comunicación.
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Para el 2009, entre la Secretaría de Hacienda y Crédito Público, la Secretaría de Gobernación y la Secretaría de la Función Pública, determinaron una estrategia para reforzar el marco normativo interno de cada institución y, al mismo tiempo, homologar los procesos y la eficiencia de la Administración Pública Federal, por lo que se elaboraron los llamados Manuales Administrativos de Aplicación General.