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Describió que una enfermedad contagiosa era transmitida por gérmenes vivientes
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Inventó el primer microscopio
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Fabricó lentes que le permitieron observar y describir "animalículos"
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Desarrolló el microscopio compuesto
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Desmintió la teoría de la generación espontánea
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Inició el estudio de la inmunidad a la viruela
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Introdujo la técnica bacteriológica de esterilización
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Publica los postulados de Koch esenciales para describir la etiología de los agentes causantes de una enfermedad infecciosa
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Dio comienzo a la quimioterapia gracias a su compuesto 606
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Junto con los estudios de Florey se inició la etapa de la antibioticoterapia.