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Se establece el Reglamento para el Gobierno Interior y Exterior de las Secretarías de Estado y Despacho Universal que sería el órgano regulador de las funciones de las primeras cuatro Secretarías que conformaron la administración pública de México. Éstas recibían el nombre de Secretarías de Estado y del Despacho Universal y cuatro fueron, por ser cuatro las causas o principios que se consideraron debería, el nuevo gobierno, vigilar para garantizar su independencia recién adquirida.
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Se establecen cuatro ministerios: Secretaría de Relaciones Exteriores e Interiores, Secretaría de Justicia y Negocios Eclesiásticos, Secretaría de Hacienda Pública, Secretaría de Marina y de Guerra.
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Establece que habrá cierto número de secretarios y una ley para los negocios del gobierno, esto estipulado en el artículo 117.
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Destaca desde luego, la pugna por el poder encabezada por los grupos conservador y liberal que caracterizó al Siglo XIX y que constituyó una gran limitante para el desarrollo del país en todos sus órdenes. En 1836, con el triunfo del grupo conservador, se crea el Supremo Poder Conservador y se elaboran las Bases y Leyes Constitucionales de la República Mexicana.
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En 1853 al final de las múltiples idas y venidas de Antonio López de Santa Anna al poder, lanza el decreto Bases para la Administración de la República por medio del cual los ministerios vuelven a recibir el nombre de secretarías y la estructura administrativa aumenta y diferencia aún más sus funciones.
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Como consecuencia del movimiento liberal se concluye con el levantamiento de Ayutla, así como la promulgación de la Constitución de 1857
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Se dio facultad al Presidente de la República, nombrar a los Secretarios y cambiar el nombre de los Ministerios
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Una vez consolidada la Revolución que concluyó con la dictadura Porfirista, Venustiano Carranza expide, en abril de 1917, la Primera Ley de Secretarías y Departamentos de Estado por medio de la cual se establecen 5 secretarías y se introduce el concepto de Departamentos de Estado como dependencias auxiliares del presidente en los asuntos de carácter técnico.
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Sufre dos modificaciones durante el período Cardenista. La primera se hizo en diciembre de 1935 para dar lugar a la creación de tres departamentos: Autónomo de Asuntos Indígenas; Educación Física y el de Forestal de Caza y Pesca. En 1937 se crea la Secretaría de Asistencia Pública y la segunda modificación a la Ley se llevó a cabo en diciembre de 1939 con el objeto de separar las funciones de Guerra y Marina en: Secretaría de la Defensa Nacional y Departamento Autónomo de la Marina Nacional.
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El Departamento del Trabajo, se convierte en Secretaría del Trabajo y Previsión Social, desapareciendo el Departamento de Seguridad Pública, y creándose la Secretaría de Marina
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Se crea la Secretaria de Bienes Nacionales e Inspección Administrativa así como la Dirección de Organización Administrativa. 13 Secretarias y 2 Departamentos.
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En 1958 se envió un proyecto de una nueva Ley de Secretarías y Departamentos de Estado, esta ha venido a derogar el ordenamiento de las secretarías y departamentos, así como la facultad que tiene el ejecutivo federal para nombrar a secretarios que estén al frente de éstas, este ordenamiento y facultad sigue vigente hasta hoy.
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La Secretaria del Patrimonio Nacional sustituye a la Secretaría de Bienes Nacionales e Inspección Administrativa.
La Secretaria de la Presidencia, la de Obras Publicas y la Secretaria de Economía, sustituye a la de Industria y Comercio Se crea el Departamento de Turismo -
Se crea la Comisión de Administración Publica, órgano dependiente de la Secretaria de la Presidencia
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Se llevó por primera vez una reforma administrativa de base y metódica que perdura hasta nuestros días.Con la llegada a la presidencia de la república de Luis Echeverría Álvarez en 1970, se iniciaron una serie de importantes reformas administrativas en México
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Se expande el sector paraestatal desordenadamente. La Dirección General de Estudios Administrativos
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Primera Ley Orgánica de la Administración Publica
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Puso en marcha el Programa Inmediato de Reordenación Económica, Iniciativa para reformar la Ley Orgánica de la Administración Pública, en la que se establecen importantes reformas que crearon varias Secretarías de Estado, entre ellas la de Energía, Minas e Industria Para estatal, la de Desarrollo Urbano y Ecología. En los años posteriores, se impulsó la simplificación administrativa, buscando agilizar trámites y dar servicios más eficaces a la ciudadanía.
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Se elimina la Secretaria de Programación y Presupuesto.
Se modifican las Secretarias: Secretarias de Desarrollo Urbano y Ecología con el nombre de Desarrollo Social. La de Salubridad y Asistencia cambio por el de Salud. -
En la misma línea de transformar a la Procuraduría se reformo la Ley Orgánica de la Administración Pública y se reprimió la referencia del procurador en la lista de los órganos de la administración centralizada, tratando de convencer que el procurador no era autónomo.
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Se crean la Secretaria de Medio Ambiente, la Recursos Naturales y Pesca y La Secretaria de Energía.
Durante su sexenio se impulsó el Programa de Modernización de la Administración Pública (PROMAP), el Sistema Integral de Administración Financiera Federa (SIAFF), la Nueva Estructura Programática (NEP) y el Sistema de Evaluación del Desempeño (SED). -
Se impulsó el Modelo Estratégico de Innovación Gubernamental. Este modelo estratégico tiene como misión recuperar la confianza de los ciudadanos en el gobierno
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El proceso de modernización administrativa se llevará en dos instancias: primero, el Programa de Mejoramiento de la Gestión, (2007-2012) a cargo de la Secretaría de la Función Pública, y segundo, el Presupuesto Basado en Resultados y el Sistema de Evaluación del Desempeño, bajo la responsabilidad de la Secretaría de Hacienda y Crédito Público.
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Presentó al Congreso de la Unión una propuesta de reforma a la estructura orgánica de la administración pública federal, mediante tal reforma se elimina de la estructura de las secretarías del poder ejecutivo a la Secretaría de Seguridad Pública y se concentran todas sus funciones en en Consejo Nacional de Seguridad Pública dependiente de la Secretaría de Gobernación, quedando también esta última como la asesora del ejecutivo en materia de política criminal
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La Constitución Política de los Estados Unidos Mexicanos determina Que "La Soberanía Nacional reside esencial y originariamente en el pueblo y se ejerce por medio de los Poderes de la Unión, en los casos de la Competencia de estos y por los de los Estados y la Ciudad de México"
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Se reformo la Ley Orgánica de la Administración Pública Federal, mediante la cual se creo la Secretaría de Seguridad y Protección Ciudadana y la Secretaría de Bienestar, se reorganizó a la Secretaría de Gobernación, y se ampliaron las facultades de la Secretaría de Hacienda, de la Oficina de la Presidencia y de la Consejería Jurídica.