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Más allá de su teoría de la endosimbiosis (mitocondrias y plastos provienen de la simbiosis entre una célula eucariota y otra procariota) defiende la simbiosis entre microorganismos como importante fuerza evolutiva.
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Afirma que el gen es la única unidad de selección verdadera (el gen egoísta), siendo los individuos o los grupos simples «vehículos» en el proceso evolutivo.
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Tanto él como Niles Eldredge proponen el modelo del equilibrio puntuado, con largos episodios sin cambios evolutivos relevantes dentro de cada especie
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Tanto él com Stephen Jay Gould proponen el modelo del equilibrio puntuado, con largos episodios sin cambios evolutivos relevantes dentro de cada especie.
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