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  Descubrió las células observando en el microscopio una laminilla de corcho
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  Observó diversas células eucariotas (como protozoos y espermatozoides) y procariotas (bacterias).
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  Describió la presencia de «animálculos» o «infusorios»; se trataba de organismos unicelulares.
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  Panteo la presencia de células en el tejido animal
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  Describió el núcleo celular.
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  observó el citoplasma celular
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  Postuló que todas las células provienen de otras células.
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  identificó las mitocondrias.
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  Realizó multitud de estudios sobre el metabolismo de levaduras y sobre la asepsia.
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  descubrió que las células actuales comparten similitud estructural y molecular con células de tiempos remotos.
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  construyó el primer microscopio electrónico de transmisión en laUniversidad de Berlín. Cuatro años más tarde, obtuvo un poder de resolución doble a la del microscopio óptico
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  publica su hipótesis sobre la endosimbiosis serial, que explica el origen de la célula eucariota