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Ideó el microscopio y consistía en dos lentes montadas dentro de un tubo.
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Sobresalió por ser el primero en realizar observaciones y descubrimientos con microscopios cuya fabricación él mismo perfeccionó.
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Desarrollo junto a Theodor Schwann de la teoría celular, que afirmaba que las células son la base de todos los seres vivos.
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Se familiarizó con la investigación microscópica de Matthias Schleiden sobre las plantas y descubrió que los animales también están compuestos de células.
