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Nació en un barco inglés que venía de Gran Bretaña a al Nueva Granada, en aguas Colombianas.
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A los 14 años entró al Liceo de la Infancia, dirigido por Ricardo Carrasquilla, durante cuatro meses le dieron clases de aritmética, geografía, religión; lectura, escritura y castellano, al cabo de los cuales el catedrático declaró que nada tenía que enseñarle en ese curso, y lo pasaron a un nivel superior.
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Entró a la recién fundada Universidad Nacional de Colombia, se tardó dos años en una carrera que duraba cinco años y se graduó en 1870 recibiendo el título de Ingeniero Civil y Militar.
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Cuando salió de la universidad se dedicó a dictar clases como profesor de la facultad de ingeniería en la Universidad nacional de Colombia
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Fue nombrado director de obras publicas del distrito de Bogotá.
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Ruperto Ferreira contrajo matrimonio con Irene Maldonado, con quien tuvo un hijo, su esposa falleció tres años mas tarde.
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Contrajo segundas nupcias con su cuñada Ana Joaquina Maldonado, con quien tuvo Cinco hijos.
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Asumió la direccion de los trabajos para la construcción del ferrocarrilde Girardot, en cuyo trazado había participado como ayudante del doctor Lievano, casi dos docenios atrás.
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Trabajó en una comisión sobre el ferrocarril y el canal en el itsmo de Panamá, con Manuel Ponce de León
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Como miembro ad honorem de la Junta Central del Meta nombrada por el ministerio de fomento en 1887 con el propósito de comunicar a Bogotá con puerto sobre el río Meta, exploró la región entre 25 de Febrero y el 19 de Marzo, conjuntamente con Ricardo Nuñez, Nicolas Casas y Jose M. Vargas.
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Fue nombrado ingeniero Jefede la comisión encargada de estudiar los limites con Venezuela .
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Ferreira fue ascendido al cargo de secretario general del ministerio de fomento y se encargo del despacho en forma interina.
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Uvo occasion de probar sus dotes de administrador entre 1890 y 1892, como gerente del ferrocarril de la Sabana.
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Falleció en Bogota Cundianamarca COLOMBIA
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Regresó a la docencia en la universidad Nacional.