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Los frailes de las 3 órdenes, llegaron a nueva españa y tuvieron que afrontar la tarea de instruir en la fe y costumbre europeas a millones de indios.
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Se celebraban reuniones en donde se determinaba la forma de impartir catecismo, bautismo, la eucaristía entre otras cuestiones. Donde estaban 12 franciscanos, entre 3 y 4 que ya se encontraban en le nueva España,5 clérigos y 3 letrados seculares.
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Se enseñaba lógica y filosofía. Se estableció en el barrio de Santiago de Tlatelolco, junto al convento franciscano. Los promotores de esta institución eran el presidente de la Segunda Audiencia y obispo de Santo Domingo don Sebastián Ramírez de Fuenleal, el obispo de México-Tenochtitlan fray Juan de Zumárraga y el primer virrey don Antonio de Mendoza.
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Los prelados de las diócesis novohispanas, criticaron diversas costumbres que se tenían sobre la enseñanza de los indios, no era bueno encerrarlos en calabozos, cortar el pelo o dar azotes, debía ser sustituido por una leve corrección.
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Hubo otra solicitud para que se permitiera el libre aprendizaje de indios, documento firmado por prelados de México, Guatemala y Oaxaca, argumentando que todos los vasallos tenían derecho de ganar su sustento.
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El fray Alonso de Monttúfar convoco esto, donde se discutieron los decretos pasados aprobados, exiliar a los indios de las ordenes sagradas, asi como la insistencia de la publicación del catecismo en las lenguas más comunes, que se redujeran los temas esenciales, como son los mandamientos, sacramentos y oraciones que todo cristiano debería saber.
