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Traerá al país la medicina de la época, la física, la cosmología copernicana y newtoniana y la matemática moderna, El mayor impacto de la actividad esfuerzo por recoger y clasificar la flora y la fauna locales.
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Realizó notables estudios botánicos y trazó el mapa del virreinato del Perú. Fue el primer director del Observatorio Astronómico de Bogotá. Fundó el primer curso de estudios de la Academia de Ingenieros en Medellín.
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Contribuyo con la zoología y botánica.
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Discurso sobre las ventajas del estudio de la filosofía, Lecciones de lógica para el curso de filosofía y Lecciones de física.
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Fue nombrado profesor de química y mineralogía. constituyó una de las primeras muestras de historia científica en el país. Hizo mediciones meteorológicas, trajo equipos y libros de Europa que donó a la Biblioteca Nacional.
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Revistas médicas publicadas en Colombia, editó la Gaceta Médica de Colombia, Revista Médica de Bogotá y primer rector de la Escuela de Medicina
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Hizo un primer estudio acerca de la geografía
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Geografía de Santander
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Se abrieron los primero laboratorios químicos.
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Organizaron la Facultad de Ingeniería de la Universidad Nacional. Obras públicas caminos, puentes, ferrocarriles, telégrafos
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Estudio de la sociología en Colombia
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El túnel de La Quiebra en su disertación de grado
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Está marcado por el surgimiento de la industria moderna
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Centros de excelencia en la formación matemática en el país.
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Instituto Geográfico Militar, que se convertiría luego en el Instituto Geográfico Agustín Codazzi
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Contribuirían en forma substancial a la consolidación de la ciencia social en Colombia.
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Inventor del primer marcapasos artificial externo con electrodos internos
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Instituto Nacional de Agricultura
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Desarrolla la vacuna contra la malaria
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Ley de Llinás o ley de la no intercambiabilidad, estudia el sistema nervioso y el comportamiento de las neuronas