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Creador de la Taxonomía. Observó 520 especies de animales y las organizó en dos categorías basadas en las semejanzas en estructura y apariencia.
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Realizó una clasificación de los organismos y los separó en útiles, peligrosos y superfluos.
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Describe la anatomía de las plantas y las clasifica según su tamaño promedio y estructura. Realizó la primera clasificación de 480 plantas en árboles, arbustos, subarbustos, hierbas
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Ordenó cada organismo en categorías taxonómicas, que van de lo general a lo particular: Reino, Filo, Clase, Orden, Familia, Género y Especie.
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Formuló la primera teoría de la evolución biológica, en 1802 acuñó el término "biología" para designar la ciencia de los seres vivos y fue el fundador de la paleontología de los invertebrados.
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Darwin investigó sobre el hecho de la transmutación de las especies y concibió su teoría de la selección natural en 1838.
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Haeckel creó un tercer reino llamado Protista, donde ubicó a todos los organismos unicelulares.
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Copeland propuso un nuevo reino, el Monera, donde agrupó a las bacterias, pues todas son procariontes.
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Propuso un esquema de clasificación con cinco reinos: el tipo celular (procariontes y eucariontes), el nivel de organización (unicelular o pluricelular), el tipo de nutrición (autótrofa o heterótrofa) y el tipo de reproducción (sexual o asexual).
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Propone la modificación del Reino Monera al encontrar que las bacterias tienen diferentes tipos de metabolismo. Propone dividirlas en dos grandes grupos, que nombró Bacteria y Archaea.
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Se opone a la clasificación de Woese. Mayr propone dividir al mundo biológico en dos: Dominio Prokaryota y Dominio Eukaryota
