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Los Dominicos y los Franciscanos fueron los primeros que iniciaron la evangelización en la época Colonial.
En 1575 vinieron los Agustinos y en el siglo XVll los Jesuitas.
En 1562 se traslada la diócesis samaria a Santafé y ésta es elevada a la categoría de arquidiócesis en 1564. -
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La iglesia se dividió en Realistas que apoyaban al rey y patriotas que apoyaban la independencia absoluta.
El alto clero (obispos y dignatarios) se unieron a los Realistas.
Los curas de parroquia apoyaron a los patriotas.
Fue muy importante la intervención del Clero en la independencia pues contribuyó al reclutamiento de las personas para el proceso independentista. -
En 1835 la santa sede reconoció la independencia de Colombia.
La iglesia participo en política. En 1853 los Liberales separaron el estado y la iglesia.
La Iglesia católica fue la única religión que tuvo una existencia reconocida en Colombia hasta 1856.
La libertad de cultos enfrentó a conservadores y liberales durante buena parte de la vida republicana. Durante la república liberal, la Iglesia se opuso al liberalismo partido y sus ideas.
La devoción al sagrado corazón de Jesús comenzó en 1868. -
La iglesia ha tenido un papel importante como mediadora para liberar secuestrados. Actualmente el fundamento de la iglesia se basa en la construcción de una sociedad mas democrática y tolerante.
Adicionalmente, desde mediados de los 80, el clero ha llamado la atención sobre el deterioro de los derechos humanos a causa de la guerra. Han visibilizado el problema del desplazamiento forzado y han abogado por el respeto al Derecho Internacional Humanitario. 3 papas han visitado Colombia.