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Publicó los resultados de sus observaciones sobre tejidos vegetales, con un microscopio de 50 aumentos construido por él mismo.
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Observó diversas células eucariotas (como protozoos y espermatozoides) y procariotas (bacterias).
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Describió la presencia de animálculos o infusorios; se trataba de organismos unicelulares.
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Estudió la célula animal; junto con Matthias Schleiden postularon que las células son las unidades elementales en la formación de las plantas y animales, y que son la base fundamental del proceso vital.
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