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Se enfrentó a la teoría, de la generación espontánea demostrando que gorgojos, pulgas y mejillones se desarrollaban a partir de huevos diminutos.
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Descubrió que la lámina de corcho tenía pequeñas cavidades poliédricas como si fuera un panal de abeja. Cada cavidad la llamó célula.
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Experimentó en el campo de la química, en particular en lo que respecta a las propiedades de los gases, los razonamientos de Robert Boyle sobre el comportamiento de la materia a nivel corpuscular fueron los precursores de la moderna teoría de los elementos químicos.