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Nació el 2 de abril de 1792, Villa del Rosario de Cucuta. Sus padres fueron Juan Agustín Santander Colmenares y Manuela Antonia de Omaña Rodríguez.
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Viajo a Santafé de Bogotá estudiar colegio mayor y seminario de san Bartolomé como calidad de becado beca bartolina.
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Graduado de Bachiller en Filosofía
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Casi culmina sus estudios de derecho pero lo sorprende la Guerra de Independencia
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Se recluto, ascendido sucesivamente a Teniente y Capitán, en menos de un mes
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Ascendido a Sargento Mayor
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Se convierte en coronel
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Participa batalla de Boyacá y ordenó fusilar en la Plaza mayor al general español José María Barreiro con 38 compañeros.
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Se convierte en vicepresidente de la Gran Colombia.
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desplazado de la vicepresidencia,juzgado y desterrado (culpado también por conspiración contra bolívar) participo en la convención de Ocaña.
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Regresa del exilio luego que bolívar muere.
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Elegido presidente interino y se firma la constitución.
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Se convierte en presidente de la nueva granada por un largo periodo de tiempo.
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Se convirtió entonces en senador y presidente del Congreso de Nueva Granada; así mismo lideró la oposición a Márquez y cuando se preparaba para iniciar su campaña por la reelección, el mismo día de pronunciar un discurso cayó gravemente enfermo y falleció en Bogotá el 6 de mayo de 1840, contando con 48 años de edad.
Su autopsia reveló, además de dos heridas de bala y una de lanza, que murió a causa de cálculos biliares razón por la cual sentía los fuertes cólico.