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1521 aconteció la Caída de Tenochtitlán llevado a cabo mediante la negociación entre civilizaciones que se encontraban bajo el yugo mexica y el conquistador español Hernán Cortés.
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Don Alfonso de Avalos llegó por el rumbo de Mazamitla en 1521, los señoríos de la región, esperando sacudirse el yugo colimote, lo recibieron en paz y así en 1522 fundó la ciudad de “Sayula como capital de la Provincia de Avalos “.
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Con gran número de esclavos, tropa y cañones, el 21 de diciembre de 1529 Nuño Beltrán emprendió una expedición para conquistar los reinos de la región occidental de Nueva España
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La expedición partió de la ciudad de México por el rumbo de Toluca e Ixtlahuaca hasta Tzinzintzan (Michoacán)
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La ciudad fue fundada en 1530, por Nuño Beltrán de Guzmán con el nombre de "Villa del Espíritu de la Nueva Galicia" En 1532, su nombre cambió a "Santiago de Compostela"
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En 1532, los naturales de Ahuacatlán (en el actual Nayarit), Compostela y Chiametla se levantaron en armas. Al final varios capitanes españoles, encomenderos y líderes militares subestimaron la magnitud del alzamiento, y lo pagaron con derrotas y pérdida del control de la región alzada.
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el virrey D. Antonio de Mendoza, ante las acusaciones y quejas que recibe, decide destituir a Nuño de Guzmán así como enviarle a España para ser sometido al juicio de residencia.
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La primera fundación de Guadalajara sucedió en 1532 en Nochistlán.
La segunda fundación se hizo en Tonalá, donde permanecería durante aproximadamente 2 años.
La tercera fundación ocurrió en 1535 en la región de Tlacotán.
Finalmente, el 14 de febrero de 1542, la ciudad de Guadalajara fue fundada por cuarta y última vez en el Valle de Atemajac