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Nace en la casa solariega de Loyola (en la parroquia de Azpeitia, Guipuzcoa), donde vivía su familia, perteneciente a la nobleza del señorío de Vizcaya.
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(1506-1517) es educado como caballero en el palacio de revelador mayor de Castilla, Juan Velazquez de Cuella, en Arevalo.
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Como soldado del virrey de Navarra, Antonio Manrique, duqye de Najera, interviene en el combate contra las tropas francesas que pretendían invadir Navarra. Es herido en ambas piernas mientras resguarda el castillo de Pamplona. A lo largo de su convalecencia de Loyola, toma la decisión de consagrar su vida a Dios.
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Retirado a una vida de oración, meditación y penitencia, redacta, en una cueva de Manresa, ejercicios espirituales, junto al rió Cardoner concibe la idea de hacer un instituto religioso para Jerusalen.
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Estudia latín en la Universidad de Barcelona
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se traslada a Salamanca, donde de nuevo es procesado