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Nació el 24 de octubre de 1632 en Delft, Holanda.
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En el año 1668, desarrolló el descubrimiento de la red de capilares del italiano Marcello Malpighi, demostrando cómo circulaban los glóbulos rojos por los capilares de la oreja de un conejo y la membrana interdigital de la pata de una rana.
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En 1674, realizó la primera descripción precisa de los glóbulos rojos de la sangre.
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En 1677 Anton van Leeuwenhoek describió los espermatozoos de los insectos y los seres humanos. Se opuso a la teoría de la generación espontánea, demostrando que los gorgojos no surgían espontáneamente a partir de granos de trigo y arena, sino que se desarrollaban a partir de huevos diminutos. Examinó plantas y tejidos musculares, describiendo tres tipos de bacterias: bacilos, cocos y espirilos.
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Anton van Leeuwenhoek falleció el 26 de agosto de 1723 en Delft, a los 90 años.