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Nació en Darvel, Escocia
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Se alistó en el London Scottish Regiment con la intención de participar en la Guerra de los Boers.
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Entró a formar parte del equipo del bacteriólogo sir Almroth Wright.
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Se licenció, obteniendo la medalla de oro de la Universidad de Londres.
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Descubrió la lisozima. Ocurrió después de que un moco de su nariz, procedente de un estornudo, cayese sobre una placa de Petri, en la que crecía un cultivo bacteriano.Unos días más tarde notó que las bacterias, habían sido destruidas en el lugar donde se había depositado el fluido nasal.
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Descubrió de la penicilina. Estaba realizando varios experimentos en su laboratorio y el día 22, al inspeccionar sus cultivos antes de destruirlos notó que la colonia de un hongo había crecido espontáneamente, como un contaminante, en una de las Placa de Petri. Fleming observó más tarde las placas y comprobó que las colonias bacterianas que se encontraban alrededor del hongo eran transparentes debido a una lisis bacteriana.
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Nombrado profesor de bacteriología,pasó a ser catedrático, retirándose como emérito en 1948.
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Comunicó su descubrimiento sobre la penicilina en el British Journal of Experimental Pathology.
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La penincilina despertó el interés de los investigadores durante la 2ª Guerra Mundial.
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Obtuvieron los primeros resultados satisfactorios con pacientes humanos. Fleming no patentó su descubrimiento creyendo que así sería más fácil la difusión de un antibiótico necesario para el tratamiento de las numerosas infecciones que azotaban a la población.
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Por fín alcanza la fama y fue elegido miembro de la Royal Society.
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Recibe el Premio Nobel De La Medicina por sus descubrimientos. Finalmente descubrirán la manera de purificar la penicilina y de la distribuir en todo el mundo. Compartió ese premio con Ernst Boris Chain y Howard Walter Florey quienes
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Ocupó la dirección hasta 1954 del Wright-Fleming Institute of Microbiology.
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Murió de un ataque cardíaco. Enterrado en la Catedral de San Pablo, Londres.
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