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Nace en la casa solariega de Loyola (en la parroquia de Azpeitia, Guipúzcoa) donde vivía su familia, perteneciente a la nobleza del señorío de Vizcaya.
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Es educado como caballero en el palacio del revelador mayor de Castilla, Juan Velázquez de Cuéllar, en Arévalo (Ávila)
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Como soldado del virrey de Navarra, Antonio Manrique, duque de Nájera, interviene en el combate contra las tropas francesas que pretendían invadir Navarra. Es herido en ambas piernas mientras resguarda el castillo de Pamplona. A lo largo de su convalecencia en Loyola, toma la decisión de consagrar su vida a Dios.
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Retirado a una vida de oración, meditación y penitencia, redacta, en una cueva de Manresa, Ejercicios espirituales. Junto al río Cardoner concibe la idea de hacer un instituto religioso. Peregrina a Jerusalén.
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Estudia lógica en Alcalá de Henares. Comienza a impartir ejercicios espirituales, actividad por la cual es considerado sospechoso de alumbramiento, procesado y condenado a no predicar durante tres años.
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El día 15 de agosto, Ignacio y otros colegas realizan en Montmartre votos de indigencia, castidad y vida apostólica. -
En este año logra el título de magister en filosofía
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Es ordenado sacerdote en Venecia. Marcha a Roma, ciudad en la que vivirá hasta su fallecimiento. -
Por medio de la bula Regimini militantis Ecclesiae el papa Pablo III aprueba de manera canónica, el 27 de septiembre, la constitución del instituto de clérigos regulares de la Compañía de Jesús, cuyos estatus ya había admitido verbalmente el año anterior. -
Es elegido superior general de la Compañía de Jesús y redacta las Constituciones de esta.
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Se publican sus Ejercicios espirituales. -
Ignacio de Loyola quiso que se le sustituyera al frente de la Compañía, pero su solicitud de renuncia fue rechazada. Al año siguiente murió Francisco Javier, a quien Ignacio tenía en mente para que le supliera. -
Debido a un conflicto, Ignacio de Loyola dirigió la Compañía desde su celda en Roma y fue ordenando todo lo que había ido creando hasta poco antes de su muerte.
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Muere el 31 de julio en su celda de la sede de los Jesuitas en Roma, como consecuencia de una larga enfermedad ligada a la vesícula.
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Es beatificado por el papa Pablo V -
En este año es canonizado por el papa Gregorio XV