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Frente Democrático Nacional se consolida formando el Partido de la Revolución Democrática (PRD) y López Obrador se convierte en presidente del partido en el estado de Tabasco.
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López Obrador acusó que hubo fraude en las elecciones de Tabasco de 1988, en seis municipios en que triunfó el PRI y en los que el PRD consideraba que había ganado
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López Obrador inició la Caravana por la Democracia, una marcha a la Ciudad de México, defendió políticas nacionales, como la oposición a la privatización de PEMEX, bloqueando el acceso a varios pozos petroleros. Las manifestaciones derivaron en la renuncia del secretario de Gobernación, Esteban Moctezuma
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Durante su gestión el partido tuvo el mayor incremento de presencia en la política nacional desde su fundación
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Durante su mandato destacó por realizar ruedas de prensa todos los días a las 6 de la mañana a partir del 31 de mayo de 2001 para contestar las preguntas de los medios de comunicación,
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López Obrador estableció un programa de pensiones para adultos mayores de 70 años con 385 mil beneficiarios.
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Inició su precampaña el 11 de agosto de 2005 con sus "50 compromisos básicos ante el pueblo de México". Tomó protesta como candidato de la Coalición Por el Bien de Todos
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Una vez concluida la elección, en la que terminó como segundo lugar, López Obrador se abocó en la defensa del sector energético. Realizó consultas, llamados y marchas a fin de convocar a la discusión de la Reforma Energética.
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López Obrador recibió, de manos de Janine M. Otálora Malassis, magistrada presidenta del Tribunal Electoral del Poder Judicial de la Federación, la constancia que lo acredita como presidente electo de México.
