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Nace en la casa solariega de Loyola (en la parroquia de Azpeitia, Guipúzcoa) donde vivía su familia, perteneciente a la nobleza del señorío de Vizcaya.
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Es educado como caballero en el palacio del revelador mayor de Castilla, Juan Velázquez de Cuéllar, en Arévalo (Ávila).
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Como soldado del virrey de Navarra, Antonio Manrique, duque de Nájera, interviene en el combate contra las tropas francesas que pretendían invadir Navarra. Es herido en ambas piernas mientras resguarda el castillo de Pamplona. A lo largo de su convalecencia en Loyola, toma la decisión de consagrar su vida a Dios.
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Retirado a una vida de oración, meditación y penitencia, redacta, en una cueva de Manresa, Ejercicios espirituales. Junto al río Cardoner concibe la idea de hacer un instituto religioso. Peregrina a Jerusalén.
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Cuelga su vestimenta militar frente la imagen de la Virgen, y abandona el monasterio donde se estaba hospedando con harapos y descalzo.
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Hasta el año estudió Latín en la Universidad de Barcelona
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Estudia lógica en Alcalá de Henares. Comienza a impartir ejercicios espirituales, actividad por la cual es considerado sospechoso de alumbramiento, procesado y condenado a no predicar durante tres años.
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Se traslada a Salamanca donde nuevamente es procesado.
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Tras caminar durante varios meses, llega a París con la tentativa de estudiar en su universidad. Adopta la forma latina (Ignatius) de su nombre de pila (Íñigo).
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Inicia sus estudios en teología
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Ignacio y otros colegas realizan en Montmartre votos de indigencia, castidad y vida apostólica.
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Logra el título de magister en filosofía.
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Es organizado sacerdote en Venecia, ciudad a la que había marchado dos años antes para terminar sus estudios de teología. Marcha a Roma, ciudad en la que vivirá hasta su fallecimiento.
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Por medio de la bula Regimini militantis Ecclesiae el papa Pablo III aprueba de manera canónica, el 27 de septiembre, la constitución del instituto de clérigos regulares de la Compañía de Jesús, cuyos estatutos ya había admitido verbalmente el año anterior.
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Es elegido superior general de la Compañía de Jesús.
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Redacta las Constituciones de la Compañía de Jesús.
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Se publican sus Ejercicios espirituales.
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Funda el Colegio Romano
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Funda el Colegio Germánico
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Por una enfermedad ligada a la vesícula.
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Es beatificado por el papa Pablo V
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Es canonizado por el papa Gregorio XV