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Esta teoría comprende que las enfermedades eran causadas por los olores fuertes en el aire que eran producidos por mal manejo de aguas negras, basuras, animales muertos y que estos olores eran la causa al ser inalados por las personas se enfermaban por estos motivos se concedió el nombre alas malaria (mal aire) fue cuando se empezó a tomar medidas como construir alcantarillados manejo de residuos orgánicos, utilizar aromatizantes y desinfectantes.
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En 1347 la muerte negra fue presagiada con catorce años de anticipación debido a una serie de acontecimientos de la época que no tenían nada que ver con las enfermedades y en 1510 que sucedió la epidemia de influenza fue pronosticada por que cuatro años atrás vieron unos cometas, un volcán en erupción y la lluvia de sangre debido esto la gente creyó que vendría algo peor y por casualidad apareció esta enfermedad.
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Esta teoría se basa en un ámbito religioso lo cual se creía que las enfermedades plagas tanto de las personas como de las plantas era un castigo de los dioses a los cuales adoraban y que ofendían con actos pecaminosos y debido a esto los dioses descargaban la furia en forma de enfermedades y plagas para lo cual creían efectivo rezar, realizar ritos de adoración, sacrificios entre otros.
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Esta teoría esta basada en la ley del yin y el yang representando a la luz y la oscuridad la causa de las enfermedades era una falla en la armonía humoral la cual constaba de unos elementos vitales: fuego, agua, viento, que se representaban como la cabeza, el corazón, y el hígado al haber fallas en la armonía de estos elementos vitales aparecían las enfermedades.
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Esta teoría estaba basada en los astros principalmente de la luna y el sol, pero también por otros planetas vecinos, se tomaba en cuenta los ciclos lunares para realizar las siembras con el fin de obtener buenas cosechas y que las plantas estuvieran sanas, cualquier cambio o evento de los astros era una premonición de que algo iba a suceder. En 1817 se especuló que debido al cambio del ciclo lunar hubiese sido el principal causante de la pandemia de colera asiático.
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La gran hambruna de Irlanda ocurrió entre 1845 y 1852 y se debió al "tizón tardío" o "gota de la papa", que arrasó los cultivos; en 1866 el alemán Antón De Bary confirmó la presunción de otros investigadores, al reproducir la enfermedad en plantas sanas inoculadas con esporas de un hongo previamente aislado de plantas enfermas, se aplicaron versiones incompletas de los postulados de Koch entre 1845 y 1868 en los primeros estudios etiológicos de enfermedades bacterianas en plantas.
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Esta teoría del germen se basa en la investigación experimental como causa verdadera. Pasteur publicó sus primeros estudios sobre la fermentación en 1857, y en 1865 identificó una estructura corpuscular parecida a glóbulos de sangre en los gusanos de seda muertos, pero en 1876 investigó la causa de la infección urinaria en el hombre, y elaboró la estrategia para establecer la conexión suficiente entre microbios y enfermedad.
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Keitt 1959 reseñó que Prévost se refería a causa directa o inmediata, y a causa secundaria (las condiciones ambientales) para clasificar las causas de las enfermedades en las plantas.