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debutó en la primera división en Gimnacia de la Plata
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se consagró campeón de la Copa Centenario
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Guillermo y Gustavo Barros Schelotto se incorporaron al Club Atlético Boca Juniors, cuando también arribó al club de La Ribera el ex Estudiantes Martín Palermo.
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Con la llegada de Carlos Bianchi a la dirección técnica de Boca, Guillermo se hizo dueño de la playera número 7, y gano la titularidad indiscutida.
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En ese momento formó la mejor dupla de atacantes del fútbol argentino junto a Martín Palermo, enemigo futbolístico en la ciudad natal de ambos.
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en 2000 salio campeon del clausura, libertadores, y de la intercontinental.