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Se inaugura los estudios de medicina en la universidad, cinco años después de la fundación en lo que actualmente se conoce como Antigua Guatemala, la primera cátedra fue dictada por el bachiller Nicolás de Sousa.
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El Dr. Miguel Fernández inicia la cátedra prima como el primer catedrático, se obtenía el título de bachiller en medicina, la carrera duraba cuatro años, no existían títulos de licenciatura o doctorado en medicina
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Se graduó el primer bachiller en medicina en la universidad de San Carlos, siendo Vicente Ferrer González.
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Se constituye como Facultad de Ciencias Médicas. La carrera constaba de 6 años, 4 de teoría y 2 de práctica hospitalaria.
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En 1778 una red de cédula donó el nuevo sitio de la Universidad.
En 1779 se ordeno la construcción. -
Solo habían 6 salones de clase. 4 gabinetes los cuáles estaban compuestos por física, histología, química orgánica y bacteriología, también estaba el salón de recreación y la biblioteca. Adjunta también hubo una escuela de comadronas que contaba con 12 alumnas.
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Se fundó a iniciativa del decano de la sociedad lo que se llama "Juventud Médica" para cultivar las ciencias universitarias.
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Debido a los daños que ocasiono el terremoto, la Facultad de Ciencias Médicas tuvo que trasladarse al Convento de Santa Catarina de Martil, que hoy corresponde al edificio del conservatorio Nacional de música,
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Por acuerdo a la rectoría, el albergue que era para estudiantes de medicina, se destina cede cultural.
Los estudiantes de medicina se trasladaron a la sede central por 26 años. -
Los estudiantes de medicina se trasladan a lo que actualmente se conoce como el Centro Metropolitano Universitario y desde esa fecha la facultad sigue el contexto " Id y enseñad a todos".
