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5 años después de la fundación de la Universidad de San Carlos de Guatemala se inauguran los estudios de Medicina en este.
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El Dr. Miguel Fernández da inicio a la cátedra como propietario de ella.
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Don Vicente Gonzales fue el primero que se graduó de bachiller en medicina de la Universidad, doctorándose el 17 de septiembre de 1717
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Por decreto constitucional se establece como facultad de ciencias médicas contando con 6 años los cuales 4 fueron de teoría y 2 de práctica hospitalaria.
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Justo Rufino Barrios fundó la primera escuela Normal, la cual fue entregada a la Escuela de Medicina y Farmacia, la cual tenía áreas nuevas y lo que se conoció como el desinfectorio nacional.
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La Escuela de Medicina y Farmacia fue inaugurada como edificio universitario, teniendo como como rector al Dr. Joaquín Yela contando con 68 estudiantes.
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A causa de un terremoto ocasionando desastres en la Escuela de Medicina y Farmacia se trasladaron al convento de Santa Catarina de Martir, siendo hoy el Conservatorio Nacional de Música, permaneciendo ahí por 4 años.
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Por causa de un incendio se trasladó la Escuela de Medicina y Farmacia a la calle de Velasco, permaneciendo ahí por 10 años. Durante este período el Ing. José Alcaine, realizó un proyecto de 4 edificios dirigidos par la Escuela Dental, Instituto antirrábico, Instituto de Vacunas y para la Escuela de Medicina.
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La facultad de Ciencias Médicas se dirige hacia el Campus Central ubicado en zona 12 de la capital.
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La facultad de Ciencias Médicas se traslada al Centro Universitario Metropolitano (CUM) ubicado en zona 11, el cual sigue ubicado ahí a día de hoy
