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Antonio Sanclamente, presidente electo de 1898-1904 por parte del partido conservador, quien generó un descontento en los liberales haciendolos a un lado y excluyendolos.
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Pablo Emilio Villar inicia la confrontaciòn no planeada en Bucaramanga, pero los liberales pierden contra las tropas del gobierno de Antonio Sanclamente.
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La guerra es declarada por parte de los liberales guerreristas, donde su principal líder era Rafael Uribe Uribe, y tenían como objetivo bloqueo de puertos, deponer el mandato de alcaldes y gobernadores y bloques de vías
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Fue un enfrentamiento militar que consistiò en que los liberales querian tomar la ciudad de Bucaramanga, ya que habían sublevado con èxito en Santander, pero fueron derrotados por las fuerzas del general Vicente Villamizar.
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Entre el 15 y 16 de diciembre de dicho año surgió un conflicto entre los liberales comandados por Rafael Uribe y las tropas de Vicente villamizar; en estos dias las tropas liberales lograron una victoria desde el puente sobre el rio Peralonso, y asi unir fuerzas para atacar y ganar la batalla.
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Esta batalla se diò entre el 11 y el 26 de mayo de dicho año, fue una batalla decisiva para el triunfo de los conservadores sobre los liberales, dado que los recursos de los liberales eran escasos y se encontraban en desventaja, huyeron a Rionegro porque los conservadores podían rodearlos, y asi los conservadores logran la victoria, dandole fin a esta guerra.
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Fue un acontecimiento pacífico por parte de Jose Manuel Marroquin, quien era el vicepresidente, quien con apoyo de los liberales y los conservadores, derrocò a Antonio Sanclamente, el cual estaba delicado de salud.
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Los representantes del gobierno y los liberales firmaron un tratado de paz en Wisconsin que terminó oficialmente la Guerra de los mil dias.
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La guerra entre los liberales y los conservadores, lo que conlleva a un deterioro en la economia del pais, y gracias a esto, Panamá solicita ser un Estado independiente de Colombia.