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El 20 de octubre de 1681 se dio inicio con los estudios de medicina en la Universidad de San Carlos, la primera Cátedra fue realizada por el bachiller Nicolas de Sousa.
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El 15 de marzo de 1688 el Dr. Miguel Fernández de origen español inicia la primera cátedra prima como propietario de ella, en esa época se obtenía el titulo de bachiller en medicina.
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El 20 de agosto de 1703 se graduó el primer bachiller en medicina en la Universidad de San Carlos de Guatemala fue Don Vicente Ferrer González y se doctoro el 17 de septiembre de 1717
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En el año 1778 una Real Cédula donó el nuevo sitio para la Universidad.En el año 1779 se ordeno a construcción del edificio que termino en el año 1851 siendo el constructor Francisco Castillo de de la Riva.
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El 7 de diciembre de 1840 por decreto constitucional se constituye como Facultad de Ciencias Medicas la carrera constaba de 6 años, 4 años de teoría y 2 años de práctica hospitalaria
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En día 17 de octubre de 1880 fue la inauguración como edificio universitario siendo su decano el Dr. Joaquin Yela contando con 68 alumnos la mitad eran de origen centroamericano.
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En 1894 se fundo la Juventud Medica para cultivar ahí las ciencias universitarias
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En 1895 se funda el instituto dental que hoy pertenece a la facultad de odontología según el decreto presidencial 203 pasa ser dependencia de la escuela de medicina y farmacia.
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Del año 1917 a inicios de 1921 se mantuvo la facultad de medicina luego del terremoto que sacudió nuevamente a Guatemala, el lugar se como hoy como el conservatorio de música.
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1921 a 1931 la facultad de medicina estuvo en la doce calle propiedad del doctor José Azurdia
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En el año 1945 el gobierno del Dr. Juan José Arévalo Bermejo otorga la autonomía a la universidad el derechos de todo sus bienes
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1975 al año 2001 la facultad de medicina tiene lugar en el centro universitario ubicado en la zona 12 donde permaneció por 26 años.
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Se traslada al Centro Universitario Metropolitano conocido como EL "CUM" ubicado en la zona 11, desde el año 2001 a la fecha la facultad de medicina continua su labor de "ID Y ENSEÑAR A TODOS" en contexto de la Salud.
