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No se tiene claro la fecha exacta del nacimiento de Juan de Austria, las fechas que encajan se llevan dos años de diferencia, 1545, 1547.
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Don Luis de Quijada viajó a bruselas a cerrar el acuerdo con Francisco Massy, violinista reconocido, a cambio de 50 ducados al mes.
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A mediados de 1551 Francisco Massy, su mujer Ana de Medina y Juan se trasladan a Leganes, donde Ana tenia tierras.
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Felipe II mediante la carta escrita años antes por su padre Carlos V, proclamo a Juan, como Don Juan de Austria, incluyéndolo en la familia real.
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Juan de Austria completo sus estudios en la Universidad de Alcala de Henares, con sus sobrinos, el Principe Carlos de Aubsburgo y Alejandro Farnesio, personajes importantes en su vida.
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Los Turcos atacaron la Isla de Malta, para defenderse se formo una flota que salio del puerto de Barcelona, Don Juan de Austria solicito ir, pero el rey se lo denegó. Juan se escapo de la corte y se dirigió Barcelona sin conseguir alcanzar la flota.
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Visto que su hermano no tenia inclinación eclesiastica, el rey Felipe II lo nombro Capitan General del Mar
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El príncipe Carlos confió a Juan sus planes de escapar de España y pasar a los Paises Bajos desde Italia, a cambio le prometió el reino de Napoles. Cuando Carlos regreso a Madrid para escuchar la respuesta de Juan y ver la negativa del mismo lo ataco, sin sufrir ninguna consecuencia.
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Juan se reunió con sus consejeros en Cartegena, y de allí partió a combatir a los corsarios haciendo paradas en Melilla y Orna
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La Reina Isabel II y el Principe Carlos murieron ese mismo año, lo que hizo a Juan llevar la flota a Cartagena y volver a Madrid.
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El rey le encomendó a Juan comandar al ejercito castellano en la rebelión de las Alpujarras. tuvo un comienzo complicado, aunque al pasar al ataque pudo entrar en la villa y recuperar todo el territorio, allí moriría Luis de Quijada.
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Después de varias negociaciones el rey firmaría la expulsión de los morisco de Granada
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Felipe II decidio unirse al papado contra los turcos, para ello puso a Juan al mando. el 20 de julio zarparon hacia Turquia, pasando por Napoles, donde Pio V lo recibiria en la iglesia de Santa Clara. dias antes de la batalla Juan reunio a su gente para preparar la tactica para la batalla. el 7 de octubre si libraria la batalla de Lepanto, la cual ganaría, llevandose numerosos botines y galeras conviertiendo a España en rey del Mediterraneo
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Juan bajo la bandera castellana tomo Túnez, reino del cual quería ser Rey, pero Felipe II se lo negó.
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Después de conquistar Túnez y con la poca confianza del rey sobre el, el rey decide nombrarlo Vicario General de Italia, para tener controlado a su hermano. Posteriormente se perderia Túnez de manos de Uluj Ali.
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Al no poder ser Gobernador de Túnez, Juan decide cambiar sus ambiciones, quiere conquistar Inglaterra y casarse con Maria I. Sus ambiciones no se pudieron llevar a cabo ya que el rey siempre se lo negó.
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Mediante una serie de acontecimientos en Países Bajos el rey Felipe II mando a Juan a gobernar allí, a lo que juan no hizo caso y fue a Madrid a re-negociar los términos de la conquista de Inglaterra. Allí visito a Magdalena de Ulloa y ante la negativa del rey se fue a Países Bajos pasando por Francia.
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A su llegada a Países Bajos se encontró con un panorama complicado, para apaciguar los ánimos firmo el Edicto Perpetuo, posteriormente en Julio de ese mimo año rompería el pacto lo que llevaría a varias guerras.
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Por varias crisis y depresiones, juan cayo enfermo y falleció dejando al mando del gobierno de Países Bajos a Alejandro Farnesio.
