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El 13 de agosto de 1521, la ciudad indígena de México - Tenochtitlan, fue capturada luego de un estado de sitio y batallas que se prolongaron durante tres meses. -
Hacia 1524 , Alonso de Avalos llego al sur de Jalisco y se quedo con la encomienda mas tarde conocida como Provincia de Avalos. -
En 1528 , el rey puso como gobernador a un hombre sanguinario y sin escrúpulos, Nuño Beltrán de Guzmán. -
En diciembre de 1529m, al frente de trescientos españoles de siete a ocho mil indios y con doce piezas de artillería , el "muy mágico señor" Nuño Beltrán Guzmán partió de la Ciudad de México y paso por Tzintzuntzun hacia los actuales territorios de Jalisco. -
La primera fundacionsucedio en 1532, en Nochistlan.La Villa de Guadalajara fue fundada por 42 vecinos , sin embargo duro poco menos de un año en ese lugar. -
La emperatriz Isabel en ausencia del emperador Carlos l expidió una real cedula en la cual ordeno que cambiara el nombre de la Conquista de la Mayor de España por el de Reino o Provincia de la Nueva Galicia , y que fundara una capital de sus conquistas con el nombre de Santiago Galicia de Compostela, lo cual ejecuto al recibir la cedula en enero de 1532. -
La monarquía volvió a la carga y dueños de la situación sometieron poco a poco a los nativos de este conflicto que se prolongo por mas de 15 años se le llamo la Guerra del MIxton.
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La segunda fundación de Guadalajara se hizo en Tonalá donde permanecería durante aproximadamente dos años. -
La tercera fundación de Guadalajara , ocurrió en 1535 en la region de Tlacotan. -
Finalmente, el 14 de febrero de 1542 . la ciudad de Guadalajara fue fundada por cuarta y ultima vez en el Valle de Atemajac , sobre el margen del rio San Juan de Dios. -
Los aires conquistadores de Nuño terminaron cuando las quejas de los indios fueron tantas que hasta la Corona Española se escandalizo , lo enjuiciaron y lo encontraron gravemente responsable lo remitieron con grilletes a España y murió en marzo de 1544.