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En este primer gobierno de Castilla se logro la estabilidad institucional y prestigio económico en el exterior debido a la cancelación de la deuda externa en el Perú.
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Sus acciones más importantes de su gobierno fueron el control sobre las Islas Lobos frente a Lambayeque, del poder de los ingleses y el tratado Herrera con el Brasil, que permite el libre comercio en el Amazonas.
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En 1857 se batieron todas las marcas en la venta del guano: este llegó a representar el 83 % de todos los ingresos estatales. El guano se convirtió prácticamente en el único sostén del Estado.
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El presidente San Román inició sus funciones el 24 de octubre de 1862, para un mandato de cuatro años, según la Constitución de 1860, pero solo llegaría a gobernar unos meses.
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En su gobierno expidió un Reglamento de Comercio, se abrió la Escuela de Artes y Oficios y se instaló el apostadero fluvial de Iquitos.
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El Congreso Constituyente de 1867 elaboró una nueva Constitución Política fuertemente liberal, incluso más que la de 1856 (que había sido su modelo). Fue promulgada el 29 de agosto de 1867. Dos días después, el 31 de agosto, Prado fue proclamado Presidente Constitucional, aunque su mandato resultaría efímero.
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Desde el primer momento señaló que era prioritario buscar la alianza entre el Ejecutivo y el Legislativo, lograr el equilibrio entre los ingresos y egresos de la Nación, reformar el sistema aduanero y promulgar la ley de los ferrocarriles.