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Paniagua dirigió un gobierno breve donde se logró la captura de Vladimiro Montesinos y se creó la Comisión de la Verdad para investigar los crímenes cometidos durante la guerra interna de los años 80 y 90.
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Durante su gobierno se inicio del despunte macroeconómico del Perú con el fomento de la inversión extranjera y la firma de tratados de libre comercio.
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Su gobierno se caracterizó por el inicio de proyectos económicos y la reestructuración de las relaciones diplomáticas .
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El 13 de julio de 2017 fue recluido de forma preventiva en el penal Barbadillo luego de haberse entregado voluntariamente, acusado presuntamente de lavado de activos .
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El 21 de marzo, a raíz del escándalo generado por los kenjivideos , Kuczynski oficializó su carta de renuncia a la presidencia del Perú.26
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Es el actual Presidente de la República del Perú por sucesión constitucional cuando se aceptó la dimisión de Pedro Pablo Kuczynski.